Shotgun Metagenomik Analizler
Shotgun Metagenomik analizler ile bir örnek içerinde bulunan tüm nükleik asit bilgisine ulaşmak mümkündür. Bu yöntem ile elde edilen toplam genomik materyalin tamamı dizilenir ve sonrasında hedef organizma gruplarına veya genlere yönelik veritabanları ile istenilen bilgilere ulaşılır. Örneğin içeriğine ve istenilen bilgilere göre elde edilmesi gereken veri miktarı ve analiz yöntemleri değişkenlik gösterir. Massive bioinformatics, hem kısa okumalar ile hem de uzun okumalar ile shotgun metagenom analizi hizmeti vermektedir.
Massive Bioinformatics, Illumina sistemleri kullanılarak standardize olan metagenomik analizlerin yanı sıra Oxford Nanopore teknolojisi ile üretilen uzun amplikonlar ile de analizler sunmaktadır. Korunmuş bölgelere sahip olmayan virüs gibi organizmalara yönelik yapılacak metagenomik analizlerde shotgun dizileme yöntemleri öne çıkmaktadır. Ayrıca, yeni enzimlerin keşfi, antimikrobiyal direnç genlerinin saptanması, ortamda bulunan mikroorganizmaların tüm genomunun oluşturulması, zamana bağlı değişim analizleri gibi bir çok farklı amaca bu analizler ile ulaşmanız mümkündür. Shotgun metagenomik analizleri hakkında daha fazla bilgi için lütfen Massive Bioinformatics ile iletişime geçin.
Biyoinformatik Analizler
Tür Çeşitliliği
Örnek içerisinde ki türlerin belirlenmesi, bu türlerin genomlarının ne kadarlık bir bölümünün kapsandığının belirlenmesi
Uzun Okumalar
DNA kalitesine bağlı olarak, 200 kb’a kadar uzun okumalar yapmak mümkün. Çok fazla genetik materyalin olduğu karışık örneklerde yüksek doğruluk ve güvenilir sonuçlar için daha uzun okumalar oldukça önem arz etmektedir.
Tüm Genom Analizleri
Metagenomik analizler sonucunda yeterince temsil edilen organizmalara yönelik tüm genom analizleri yapmak ve bu tüm genomlara yönelik karşılaştırmalı çalışmalar gerçekleştirmek mümkündür.
Fonksiyonel Analizler
Elde edilen sonuçlar özelleştirilmiş veritabanları ve gelişmiş arama algoritmaları ile kullanılarak, genlere ait fonksiyonel bilgilere ulaşmak mümkündür.
